为推进教会在参与社会服务和公益慈善事业上的可持续发展，增强整合社会资源和服务社会的能力，2015年7月13日，南京市天主教申请成立的“南京方舟慈善基金会”正式获得市民政局的批准，取得了基金会法人登记证书。
南京方舟慈善基金会为非公募性的基金会，由南京市天主教爱国会和石鼓路天主堂共同发起，原始基金数额贰佰万元，业务主管单位为南京市民族宗教事务局。南京市天主教公益慈善活动将以此为新的开端，以“承仁爱精神，汇社会力量，行扶弱善举，促和谐社会”为宗旨，以南京为中心并辐射全省，开展以助残、助老、助学、救灾等为主要业务范围的慈善工作和服务。基金会首届理事会成员9名，监事会成员3名，陆新平任基金会名誉理事长，高源任理事长。
